新加坡中学教育是采取分流制度，为学生提供四种不同的课程选择，让学生能够根据自己的学习能力、进度和学习倾向，选择一种符合自己的学习课程。这个也充分体现出了新加坡教育政策上对学生是采取因材施教。
中学阶段耗时四至五年，视不同课程而定。特别源流课程和快捷源流课程为期四年。而普通课程(学术)和普通课程(工艺)则为四年至五年课程。这种分流制度不仅仅体现因材施教原则，还能够使不同学生都能够找到自己的特称和爱好，并为之努力就能活得自己领域里的最优，其实是一种最有效的公平。这一政策保障了校长有一定的办学自主权，使执行力依据科学，站在为学生终生发展角度为不同学生设计课程。
在中学低年级(1、2年级)，特殊/快捷课程和普通学术课程中所有课程为必修课，包括了：英语、母语(部分学生为高级母语)、数学、科学、人文(包括历史和地理)、英国文学、美术、技术、家政、公民教育、体育和音乐。而普通技术课程学生所有课程也是必修，包括了英语、母语、数学、计算机应用、科学、技术、家政、社会、公民教育、美术、音乐和体育。在中学2年级末，根据学生的成绩和学生的选择，以及学校的课程设置，可以决定3、4年级的部分课程。
中学3、4年级的课程是为普通文凭或N水准考试而设置的，选修的课程将是考试的课程。在特殊/快捷课程，必修课包括英语、母语(或高级母语)、数学，学生可以选择一至三门科学课程(包括物理、化学和生物)、一至两门人文课程(包括历史、地理、社会、英国文学，小部分学生可选择马来文学或中国文学)，数学成绩优异者还可以选择高级数学。还有的学生则可以选读音乐或美术。大多数新加坡学生选读7-9门课程参加最终的普通文凭考试。除此之外体育和公民教育两科为必修课，但是没有考试。
中学生也必须参与课文辅助活动(Co-Curricular Activities)(以前称为课外活动)，课外活动成绩在申请进入理工学院或技术学院时可以作为一门课程的成绩，但是申请进入初级学院只能作为加分，而不能作为一门课程的成绩。据介绍，考试成绩分为9等：A1、A2、B3、B4、C5、C6、D7、E8、F9，其中C6以下为不及格。在普通文凭考试结束后，学生要选择一门语文(英语或高级母语)、一门数学或科学、一门人文科学，以及三门学科的成绩(l1r5)，将所得等级相加，分数低者为优。修读高级母语并获得A1的学生能够从总分中扣除2分，而课外活动获得A1的学生也可以扣除2分，根据最后所得l1r5的成绩申请进入适合的初级学院或理工学院。要申请进入初级学院的学生，总分不得高于20分，英语等级至少C6，第二语言等级最少D7，数学最少D7。